永磁脱水槽的选分过程是：矿浆由给矿沿切线方向给入拢矿圈，矿浆下旋均匀地撒布在塔形磁极上面。磁性矿粒在磁力和重力联合作用下，克服上升水流阻力，被吸在磁系上，吸的足够多就掉下来，变为沉砂，经排矿口流出。非磁性物中的粒度较小者，受上升水流作用向上运动，由溢流槽排出，而粒度大的非磁性物不易上升，因而也随磁性物排出。

永磁脱水槽主要用来脱除细粒矿石和矿泥，而不能脱掉大粒脉石，抛弃粗粒尾矿能力不如磁选机。为了造成上升水流，给水装置是始终给水，耗水量较大。永磁脱水槽精矿品位没有磁选机高，但回收率比磁选机高。